Es que ahi tendrias que ver que tipo de formacion quieres para esa carrera. Pero en calidad las dos son muy buenas, y si estudias en cualquiera de las dos nunca te faltara pega, ademas que esa carrera ahora esta muy demandada porque no la tienen muchas universidades (ninguna no tradicional)...
Por ejemplo la Sherwin Williams solo contrata de la USACH o de la UTFSM, por que el tipo de profesional que desean es ese...
Por cierto no te engañes mucho con el nombre de la carrera, ya que mas que quimica se trata de la gestion de procesos industriales de macro o microempresas.